Canadian Journal of Botany - Revue Canadienne de Botanique (2003) 81, 976-984

Matthias Stoll, Meike Piepenbring, Dominik Begerow and Franz Oberwinkler (2003)
Molecular phylogeny of Ustilago and Sporisorium species (Basidiomycota, Ustilaginales) based on internal transcribed spacer (ITS) sequences
Canadian Journal of Botany - Revue Canadienne de Botanique 81 (9), 976-984
Abstract: DNA sequence data from the internal transcribed spacer (ITS) region of the nuclear rDNA genes were used to determine a phylogenetic relationship between the graminicolous smut genera Ustilago and Sporisorium (Ustilaginales). Fifty-three members of both genera were analysed together with three related outgroup genera. Neighbor-joining and Bayesian inferences of phylogeny indicate the monophyly of a bipartite genus Sporisorium and the monophyly of a core Ustilago clade. Both methods confirm the recently published nomenclatural change of the cane smut Ustilago scitaminea to Sporisorium scitamineum and indicate a putative connection between Ustilago maydis and Sporisorium. Overall, the three clades resolved in our analyses are only weakly supported by morphological characters. Still, their preferences to parasitize certain subfamilies of Poaceae could be used to corroborate our results: all members of both Sporisorium groups occur exclusively on the grass subfamily Panicoideae. The core Ustilago group mainly infects the subfamilies Pooideae or Chloridoideae.

Afin de déterminer la relation phylogénétique des genres Ustilago et Sporisorium (Ustilaginales), responsables du charbon chez les graminées, les auteurs ont utilisé les données de séquence de la région espaceur transcrit interne (ITS) des gènes nucléiques ADNr. Ils ont analysé 53 membres de ces genres, ainsi que trois genres apparentés. Les liens avec les voisins et l'inférence bayésienne de la phylogénie indiquent la monophylie d'un genre Sporisorium bipartite et la monophylie d'un clade Ustilago central. Les deux méthodes confirment le changement de nomenclature récemment publié faisant passer le charbon du roseau d´Ustilago scitaminea à Sporisorium scitamineum, et indiquent un lien possible entre l´Ustilago maydis et le genre Sporisorium. Dans l'ensemble, les trois clades résolus dans ces analyses ne sont que faiblement supportés par des caractères morphologiques. Tout de même, leurs préférences comme parasites de certaines familles de Poaceae pourraient être utilisées pour corroborer les résultats obtenus : tous les membres des deux groupes de Sporisorium se retrouvent exclusivement dans la sous-famille Panicoideae. Le groupe central Ustilago infecte les sous-familles Pooideae ou Chloridoideae.
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Database assignments for author(s): Meike Piepenbring, Dominik Begerow

Research topic(s) for pests/diseases/weeds:
identification/taxonomy

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Pest and/or beneficial records:

Beneficial	Pest/Disease/Weed	Crop/Product	Country	Quarant.
	Ustilago (genus)
	Sporisorium (genus)