Canadian Journal of Plant Pathology (2002) 24, 233-238

L.M. Kawchuk, L.J. Hutchison, C.A. Verhaeghe, D.R. Lynch, P.S. Bains and J.D. Holley (2002)
Isolation of the ß-tubulin gene and characterization of thiabendazole resistance in Gibberella pulicaris
Canadian Journal of Plant Pathology 24 (2), 233-238
Abstract: Gibberella pulicaris (anamorph: Fusarium sambucinum), is a common potato pathogen that produces trichothecene mycotoxins and reduces plant yield and tuber quality. Field isolates have been recovered from western Canada that are resistant to thiabendazole, a benzimidazole fungicide registered in many countries to control dry rot in storage. To characterize this resistance, homokaryons were derived from single ascospores that were produced in vitro from crosses of thiabendazole-resistant G. pulicaris field isolates with sensitive isolates of an opposite mating type. The ß- tubulin gene was amplified from these homokaryons using degenerate oligonucleotides synthesized to conserved sequences of the ß-tubulin gene derived from related fungi. An open reading frame containing three putative introns and a deduced amino acid sequence of 446 amino acids exhibited a high level of homology to the ß-tubulin gene of other fungi. Although nucleotide and amino acid differences were observed in the ß-tubulin gene, none were linked to the thiabendazole resistance. Linkage analysis confirmed that the isolated ß-tubulin gene is single copy and was not linked to thiabendazole resistance in G. pulicaris.

Le Gibberella pulicaris (anamorphe : Fusarium sambucinum) est un agent pathogène courant de la pomme de terre qui produit des mycotoxines trichothécènes et réduit les rendements et la qualité des tubercules. Des isolats, provenant de champs de l'Ouest canadien, se sont avérés résistants au thiabendazole, un benzimidazole et un fongicide enregistré dans plusieurs pays pour lutter contre la pourriture sèche fusarienne en entrepôt. Pour caractériser cette résistance, des homocaryons provenant d'ascospores isolées produites in vitro dans des croisements d'isolats de champ de G. pulicaris résistants au thiabendazole avec des isolats sensibles d'un type sexuel opposé. Le gène de la ß-tubulin de ces homocaryons a été amplifié à l'aide d'oligonucléotides dégénérés conçus en fonction des séquences conservées du gène de la ß-tubulin de champignons apparentés. Un cadre de lecture ouvert, contenant trois introns probables et une séquence déduite de 446 acides aminés, présentait un degré d'homologie élevé avec le gène de la ß-tubulin d'autres champignons. Bien que des différences au niveaux des nucléotides et des acides aminés aient été trouvées pour le gène de la ß-tubulin, aucune n'a pu être associée à la résistance au thiabendazole. L'analyse de liaison a confirmé qu'il n'y avait qu'une copie du gène de la ß-tubulin isolé et qu'il n'était pas associé à la résistance du G. pulicaris au thiabendazole.
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Database assignments for author(s): Piara S. Bains

Research topic(s) for pests/diseases/weeds:
pesticide resistance of pest

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Pest and/or beneficial records:

Beneficial	Pest/Disease/Weed	Crop/Product	Country	Quarant.
	Fusarium sambucinum	Stored fruits/vegetables