Canadian Journal of Plant Pathology (2003) 25, 240-248
He-Ping Li, Cheng-Ying Fu, Dieter Peschen, Xing-Yuan Ling, Rainer Fischer and Yu-Cai Liao (2003)
Cloning and characterization of a gene coding for a class I chitin synthase from Fusarium graminearum
Canadian Journal of Plant Pathology 25 (3), 240-248
Abstract: The full-length sequence of a gene coding for a class I chitin synthase (Chs) from Fusarium graminearum (Fg) was isolated by genome walking, using gene-specific primers and walking libraries constructed with a panel of eight restriction enzymes. Analysis of the gene (named FgChs1) and its corresponding cDNA revealed an open reading frame of 2703 bp interrupted by two introns of 120 and 55 bp, respectively. FgChs1 is a single-copy gene. Its deduced amino acid sequence shows 77% identity to Neurospora crassa Chs3 and 73% identity to Ophiostoma novo-ulmi ChsA in the conserved central region (residues 153 to 800). Quantitative reverse transcription - polymerase chain reaction was used to compare the levels of FgChs1 mRNA at different stages of development. This showed that FgChs1 was developmentally regulated, with peaks of expression during spore germination and mycelial growth. The first significant increase in FgChs1 mRNA levels was detected after 1 day of hyphal growth while the second peak was apparent after 5 days. This result suggests that FgChs1 may play an important role in fungal growth and development.
La séquence complète d'un gène de chitine synthase (Chs) de la classe I provenant du Fusarium graminearum (Fg) a été isolée par marche sur génome à l'aide d'amorces spécifiques au gène et de bibliothèques construites pour la marche avec un groupe de huit enzymes de restriction. L'analyse du gène (nommé FgChs1) et de son ADNc correspondant a révélé un cadre de lecture ouvert de 2703 pb interrompu par deux introns de 120 et 55 pb, respectivement. Il n'y a qu'une seule copie du gène FgChs1. La séquence en acides aminés qui en a été déduite montre une homologie de 77% avec la Chs3 du Neurospora crassa et de 73% avec la ChsA de l´Ophiostoma novo-ulmi en ce qui a trait à la région centrale conservée (résidus 153 à 800). La méthode quantitative de transcription inverse - réaction en chaîne de la polymérase a été employée pour comparer les niveaux d'ARNm du FgChs1 à différents stades de développement. Cette expérience a montré que le FgChs1 était régulé au cours du développement, avec des pics d'expression lors de la germination des spores et de la croissance du mycélium. La première augmentation importante du niveau d'ARNm du FgChs1 a été détectée après une journée de croissance de l'hyphe alors que le second pic est apparu après 5 jours. Ces résultats laissent croire que le FgChs1 peut avoir un rôle important dans la croissance et le développement du champignon.
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Database assignments for author(s): Yu-Cai Liao
Research topic(s) for pests/diseases/weeds:
molecular biology - genes
Pest and/or beneficial records:
Beneficial | Pest/Disease/Weed | Crop/Product | Country | Quarant.
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Fusarium graminearum |