Canadian Journal of Botany - Revue Canadienne de Botanique (1999) 77, 1490-1498

Tod D. Ramsfield, Simon F. Shamoun, Zamir K. Punja and William E. Hintz (1999)
Variation in the mitochondrial DNA of the potential biological control agent Chondrostereum purpureum
Canadian Journal of Botany - Revue Canadienne de Botanique 77 (10), 1490-1498
Abstract: The mitochondrial DNA (mtDNA) of Chondrostereum purpureum (Pers.:Fr.) Pouzar was extracted and purified, and the size ranged from 51.8 to 66.4 kb. One isolate each from British Columbia, Alberta, Finland, the Netherlands, and New Zealand were found to have identical BamHI mtDNA restriction patterns, resulting in a mitochondrial genome of 63.8 kb. An additional isolate from British Columbia and one from Switzerland had different banding patterns, however, resulting in mitochondrial genomes of 66.4 kb and 51.8 kb, respectively. A sequence-characterized amplified region (SCAR) assay, based on a polymerase chain reaction, was developed to rapidly screen a larger population of 84 isolates from North America, Europe, and New Zealand. Two SCARs, one encoding the NADH 4 gene (3 kb) and the second encoding the ATPase VI and cytochrome b genes (5.1 kb), were digested with 24 restriction enzymes. There were no polymorphisms in the NADH 4 containing SCAR, while a single polymorphism was detected by NsiI in the ATPase VI - cytochrome b containing SCAR. Two mitochondrial haplotypes that were distributed throughout the sample population were thus identified. The coancestry coefficient for all subpopulations of the sample population was calculated to be 0.0353. The level of gene diversity in the mtDNA ofC. purpureum suggested that the chance introduction of novel mitochondrial genes following biological control applications of the fungus is relatively low.

Les auteurs ont extrait et purifié l'ADN mitochondrial (ADNmt) du Chondrostereum purpureum; ses dimensions varient de 51,8 à 66,4 kb. A partir d'isolats uniques provenant de la Colombie britannique, de l'Alberta, de la Finlande, de la Hollande et de la Nouvelle-Zélande on retrouve des patrons de restriction identiques pour le BamHI ADNmt, donnant un génôme de 63,8 kb. Cependant, un autre isolat de la Colombie britannique et un isolat de la Suisse montrent des patrons de bandes différents, donnant des génômes de 66,4 kb et 51,8 kb, respectivement. Les auteurs ont développé un test pour la région amplifiée caractérisée par la séquence (SCAR) basée sur la polymérisation en chaîne, pour tamiser rapidement une plus grande population de 84 isolats provenant de l'Amérique du nord, de l'Europe et de la Nouvelle-Zélande. Deux SCARs, un codant pour le gène NADH 4 (3 kb) et un second codant pour les gènes de l'ATPase VI et du cytochrome b (5,1 kb), ont été traités avec 24 enzymes de restriction. On ne trouve pas de polymorphisme dans le SCAR de la NADH 4, alors qu'un polymorphisme unique est décelé par le NsiI dans le SCAR contenant l'ATPase et le cytochrome b. Deux haplotypes mitochondriaux, qui sont distribués dans l'ensemble de la population, ont été identifiés. Le coëficient de coancestrie calculé pour toutes les sous-populations de la population échantillonnée est de 0,0353. Le degré de diversité observé dans l'ADNmt du C. purpureum suggère que la possibilité d'une introduction aléatoire de nouveaux gènes mitochondriaux, suite à l'application du champignon pour la maîtrise biologique, est relativement faible.
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Database assignments for author(s): Simon Francis Shamoun, William E. Hintz

Research topic(s) for pests/diseases/weeds:
biocontrol - natural enemies
Research topic(s) for beneficials or antagonists:
non-target effects/fate in environm.
general biology - morphology - evolution

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Pest and/or beneficial records:

Beneficial	Pest/Disease/Weed	Crop/Product	Country	Quarant.
Chondrostereum purpureum (weed pathogen)			Finland
Chondrostereum purpureum (weed pathogen)			Netherlands
Chondrostereum purpureum (weed pathogen)			Switzerland
Chondrostereum purpureum (weed pathogen)			New Zealand
Chondrostereum purpureum (weed pathogen)			Canada (west)