Canadian Journal of Botany - Revue Canadienne de Botanique (1999) 77, 1813-1820

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Pedro W. Crous, Ji-Chuan Kang, Conrad L. Schoch and Godwin R.A. McHau (1999)
Phylogenetic relationships of Cylindrocladium pseudogracile and Cylindrocladium rumohrae with morphologically similar taxa, based on morphology and DNA sequences of internal transcribed spacers and beta-tubulin
Canadian Journal of Botany - Revue Canadienne de Botanique 77 (12), 1813-1820
Abstract: Unidentified strains of Cylindrocladium that were baited from soil in the Amazonas state of Brazil or isolated from Adiantum in the Netherlands were examined morphologically and analysed phylogenetically in comparison with reference strains. Phylogenetic trees inferred from the 5.8S subunit and flanking internal transcribed spacers (ITS1 and ITS2) of rDNA, as well as the beta-tubulin gene, separated species in accordance with their morphological features and characteristics. Although species differences based on ITS sequences were consistent, there were only a few informative sites available, making it difficult to clearly identify the unknown strains. Better resolution in separation of species was achieved from the beta-tubulin data. The strains baited from soil in Brazil were found to represent two species, namely Cylindrocladium gracile (Bugnic.) Boesew. and Cylindrocladium pseudogracile Crous. Morphologically, these two species are similar, except that the latter has slightly narrower, 1(-3)-septate conidia, and produces a Calonectria teleomorph. Furthermore, the strain from the Netherlands represents Cylindrocladium rumohrae El-Gholl and Alfenas, a species previously known only from Panama. Results of this study also indicated that the beta-tubulin gene is phylogenetically more informative than the ITS regions for distinguishing species of Cylindrocladium.

Par des études morphologiques et par analyse phylogénétique, les auteurs ont comparé des souches non-identifiées du Cylindrocladium trappées à partir du sol dans l'état Amazonas du Brésil, ou isolées à partir d´Adianthum en Hollande, et ils les ont comparées avec des souches de référence. Les dendrogrammes obtenus à partir de la sous-unité 5.8S et des espaceurs internes transcrits limitrophes (ITS1 et ITS2) du rADN, ainsi que du gène de la tubuline, permettent de séparer les espèces selon leurs particularités morphologiques et leurs caractéristiques. Bien que les différences spécifiques basées sur les séquences ITS soient congruentes, il n'y a que peu de sites révélateurs disponibles, ce qui rend difficile l'identification précise des espèces inconnues. On obtient une meilleure séparation des espèces à l'aide des données de la beta-tubuline. On constate que les souches obtenues à partir du sol au Brésil représentent deux espèces, nommément le Cylindrocladium gracile (Bugnic.) Boesew. et le Cylindrocladium pseudogracile Crous. Morphologiquement, ces deux espèces se ressemblent, sauf que la dernière porte des conidies 1(-3)-septées légèrement plus étroites, et qu'elle produit un téléomorphe de type Calonectria. De plus, la souche provenant de la Hollande correspond au Cylindrocladium rumorhae El-Gholl and Alfenas, une espèce précédemment connue seulement au Panama. Les résultats de cette étude indiquent également que le gène de la beta-tubuline est plus utile en phylogénie que les régions de l'ITS, pour distinguer les espèces du Cylindrocladium.
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Database assignments for author(s): Pedro W. Crous

Research topic(s) for pests/diseases/weeds:
identification/taxonomy


Pest and/or beneficial records:

Beneficial Pest/Disease/Weed Crop/Product Country Quarant.


Calonectria brassicae Brazil (NW)
Calonectria gracilis Panama
Calonectria gracilis Brazil (NW)
Calonectria rumohrae Netherlands
Calonectria rumohrae Panama